MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1 plasmid

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022228	CAAA	2	8	10	17	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022228	A	6	6	15	20	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022228	TAA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022228	T	6	6	868	873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022228	TA	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022228	AGA	2	6	1092	1097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022228	GAT	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022228	TTTG	2	8	1150	1157	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022228	T	9	9	1205	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022228	A	6	6	1770	1775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022228	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022228	A	7	7	1934	1940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022228	CAT	2	6	1942	1947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022228	TTGG	2	8	2009	2016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022228	GT	3	6	2032	2037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022228	CAAC	2	8	2080	2087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022228	AC	4	8	2106	2113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022228	CCAA	2	8	2120	2127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022228	A	7	7	2180	2186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022228	AC	3	6	2199	2204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022228	CTTT	2	8	2277	2284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022228	T	6	6	2282	2287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022228	A	7	7	2293	2299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022228	TC	3	6	2313	2318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022228	AAT	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022228	TCA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022228	AGG	2	6	2423	2428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022228	A	6	6	2429	2434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.